当前位置:新闻首页  广东快乐十分平台

广东快乐十分平台-广东快乐十分app

2020年02月14日 13:08:20 来源:广东快乐十分平台 编辑:广东快乐十分注册

【创科广场】病毒解药如沙里淘金 超级电脑助药物定位

迄今,新冠病毒尚无正式解药,新药从开发以至临牀,需时多月至上年。中国开始试用于其他病毒的解药,以药物重新定位方式,即为经批准的药物之中,找到对付病毒的特性,以加快治疗新冠病毒。目前,中国试用的药物以蛋白酶抑制剂(Protease inhibitor)为主,未成熟的新病毒须利用另一种酵素,叫蛋白酶才能成熟,再感染其他健康的细胞,蛋白酶抑制剂就可抑制繁殖,降低转换酶的表达,病毒无法成熟抑制毒复制,达到治疗效果。寻觅蛋白酶抑制较早前,中国尝试以抑制爱滋病毒HIV-1的新药Darunavir,以对付新冠病毒,属蛋白酶抑制剂。近期,武汉医院临牀使用Remdesivir,乃美国药厂Gilead Sciences开发用于伊波拉病毒,亦属蛋白酶抑制剂。但是,如何决定不同蛋白酶抑制剂疗效,有如大海捞针,即使以临牀测试,亦需时数月,目前仅有约2%蛋白质,具有较准确的结构数据;大量蛋白质均未知结构和功能。抗体与抗原结合面,有如互补的积木,两者结合为好像锁与钥匙(lock & key)的关系,不过找到适合的抗体,就必须精确知道蛋白酶的凹陷区域(Cavity)。蛋白质都是由20种不同的L型α氨基酸连接形成多聚体,形成蛋白质后,这些氨基酸又被称为「残基」(Residue)。近代生物资讯学(Bioinformatics)可通过超级电脑,预测蛋白质结构和残基,通过计算方法,为实验探究新药提供宝贵线索,更快找到新冠病毒解药。全球科学家都与时间竞赛,以超级电脑寻觅新冠病毒的治疗方法。奥地利初创Innophore就以超级电脑,推断出病毒的3D蛋白结构,结果跟其他实验室结果脗合,有助加速发现不同蛋白酶抑制剂,甚至估计现时药物治疗效果,加快临牀测试和药物采用。Innophore位于奥地利南部Graz市,率先以数码方式建立病毒3D蛋白模型,以开发蛋白酶抑制剂抑制新冠病毒,迅速获得各界响应,协调欧洲多家最顶尖病理研究和超算中心。2月5日建立Fastcure平台,支持计画的多个欧洲超算中心,包括奥地利Graz大学、Graz科技大学、Vienna Science Cluster、巴塞隆拿超级电算中心。Innophore成攻玉之石巴塞隆拿超级电算中心为欧洲最强超级电脑,2019年排名全球Top 500第29位,也是Lenovo欧洲建立最大超算丛集系统。Innophore只是一家小型研究型初创,还不是研究传染学专家,却是开发蛋白酶的生物资讯学专家。不过Innophore建立的Catalophore平台,利用数据和人工智能,针对自动发现蛋白酶及消费工业的酵素,却作他山之石,发现用作蛋白酶抑制剂的抗体。Innophore通过快速发现酵素技术,转用在药物筛选(Drug- screening),原理以超级电脑向壁虚构,毋须获真正新冠病毒,以数码方式先为病毒建立3D蛋白模型的点云,再对比不同蛋白数据库(PBD)上蛋白结构数据,从蛋白质表面的凹陷区域,推断不同蛋白酶抑制剂,应用在病毒上治疗效果。原则上,开发蛋白酶抑制剂,须先掌握蛋的结构,传统上重构病毒蛋白结构,以X射线晶体学(X-Ray Crystallography)技术,蛋白晶体化后以X射线重建,从衍射光线分析重建结构,过程耗时至少数月,甚至长达数年。近年,科学界发展低温显微技术(cryo-EM)代替X射线晶体学,所需时间更短,不过仍属初步。2 月3日,加大柏克莱分析的Lawrence Livermore国家实验室,公布以电脑推算的新冠病毒的3D蛋白结构,以SARS病毒蛋白结构,加上新冠病毒基因排序,推测出新病毒的蛋白模型,根据模型再研究蛋白酶和抗体的凹陷区域,预测医疗用抗体在抑制病毒的效果。不久,Innophore公布利用Catalophore平台,同步以预测蛋白结构的免费网上服务Phyre2,两者建立同源性模拟(Homology model),同时获得蛋白酶抑制剂与SARS病毒蛋白表现,发现高度脗合的凹陷区域,以建立新冠毒病的蛋白酶,残基脗合度高达100%,足以开发抗衡病毒抑制剂。消息公布后,中国疾病预防控制中心(CCDC)马上联络Innophore,高度重视此发现。Innophore以电脑发展蛋白酶抑制研究,以演算和大数据分析,作为配对蛋白酶抑制搜寻引擎,比实验室内逐一测试要快得多。Innophore的发现可以现有药物重新定位,药物毋须再经冗长的临牀审批,已有北京药厂接触Innophore寻求合作。不过以上述方法消耗大量的算力,Fastcure集合全欧最强超算,加上整合研究流程,务求最短时间找出合适的蛋白酶抑制剂。Fastcure计画包括多家欧美知名学府;Graz大学、Graz医科大学、牛津大学、维也纳医科大学、西班牙武康大学(Universidad Catolica San Antonio De Murcia)、奥地利因斯布鲁克大学(University of Innsbruck)、哈佛大学医学院、德国亥姆霍兹传染研究中心(Helmholtz Centre for Infection Research)、上海科技大学、意大利L. Spallanzani国家传染病研究所等。欧洲的病毒学和抗体研发先进,意大利L. Spallanzani国家传染病研究在诊断到两名中国游客有阳性反应之后,不到两天分离出2019-nCoV病毒,速度惊人,其后法国巴斯德研究所(Pasteur Institute)分离出2019-nCoV。https︰//innophore.com/2019-ncov/全文刊于《星岛日报》「创科广场」

夜店被问「买可乐」!广东快乐十分官网女大生秒冲超商 咸湿含义曝…她羞爆

友情链接: